2016年12月，經由外交部駐蒙古代表處安排，國立蒙古博物館 (National Museum of Mongolia) 館長SUKHBAATAR Dagvadorj博士等3人訪問臺灣，並於12月21日至本館參觀，同時簽署合作備忘錄，開啟了雙方未來交流合作之契機。 2017年8月時，國立蒙古博物館來函邀請本館人員至該館參訪，本館經相關組室會商後，於2018年1月同意依該館建議於7月時組團回訪，參加該國國家慶典，並參訪文化考古遺址。 此行除增加本館對蒙古的瞭解之外，並與國立蒙古博物館館長及研究人員正式會面，深入討論未來可能合作之項目，行程結束返臺時，本館同仁對於雙方可能合作之項目已有初步的規劃，期待在未來能獲得教育部和科技部的經費支持，順利推動臺蒙在文化考古上的合作。