漁訓二號此次依行程規劃原訂於2016年7月7日出港前往東京，然而由於颱風影響延後至7月9日下午2點出港，並於當日下午完成安檢之後隨即由前鎮漁港出海，8月1日回港結束海訓返回基隆，期間安排停靠日本東京及長崎兩港，並進行海上之漁撈與航海訓練以及靠港之陸上參訪活動。本訓練航程由兩位老師領隊，去程（高雄至東京）由廖正信老師擔任領隊老師，回程（東京—長崎—基隆）由王勝平擔任領隊老師。