美國陸戰隊戰爭學院於1990年8月1日設立，學院初期主要教育重心為陸戰隊戰爭藝術研究，為美軍幾個戰爭學院中最年輕的一所。1992年12月，陸戰隊戰爭學院受到美軍聯戰專業軍事教育第一階段（JPME Phase I）認證，正式成為美軍聯戰教育 的一環。2001年，陸戰隊戰爭學院受到美國南部學院學會（the Southern association of Colleges）所認證，並授權該學院核發畢業學員戰略研究碩士學位。2006年9月，陸戰隊戰爭學院成為第一個資深軍種學院獲得美軍聯戰專業軍事教育第二階段（JPME Phase II）授權，更於2009年1月學院被完全的授予聯戰教育認證程序。