藥廠或藥商的產品品質並非最後檢驗合格即可，必須由其使用的原物料、廠房、儀器設施開始管理，後續無論是製造、包裝檢驗儲存及運送皆須持續要求符合GMP相關規定，才可保證品質無虞。因此對於原物料或製造、檢驗及校正服務的供應商，必需進行進行評選及持續管理以確保產品品質，而稽核是評選及管理供應商的最常見的工具。 稽核供應商之依據通常是GMP相關法規、國際規範或客戶與供應商雙方的協議。因對品質要求項目繁多，所以通常雙方不會將品質要求詳列於合約，而是另行簽訂品質協議。 藥廠或藥商通常有許多供應商，在資源有限的情況下，可利用風險評估決定各供應商之稽核頻率及深度，並將稽核排程寫入稽核計畫中。稽核計畫另應包含稽核團隊組成，依稽核型態或標的，選擇適當的稽核人員，並分派稽核任務。而稽核後應撰寫稽核報告，決定供應商是否符合要求，必要時提供供應商稽核缺失甚至是改善建議。