日本獨立行政法人海洋研究開發機構（Japan Agency for Marine Science and Technology：JAMSTEC）本部位於橫須賀，並設有むつ(舊名大湊田名部市)研究所（位於青森縣）、東京事務所、橫濱研究所、高知コア研究所、國際海洋環境中心（位於沖繩縣）等其他5個分部，組織分成「役員」、「研究部門」、「開發及運用部門」、「經營管理部門」。其中，役員設有理事長1人，理事3人，監事2人；「研究部門」設有戰略研究開發領域（下轄8個中心、實驗室及計畫團隊）、基幹研究領域（下轄11個研究領域）、むつ研究所、高知コア研究所、研究推進部；「開發及運用部門」設有海洋工學中心（下轄海洋技術開發部等4個研究船管理室）、地球情報基盤中心（下轄6個研究開發部）、地球深部探查中心（下轄運用部等5個單位）；「經營管理部門」設有經營企劃部、總務部、人事部等8個單位，全機構人員約1000位，年度預算約400億日幣。重要的研究設施包括8艘研究船、8搜載人與無人潛水載具、地球模擬設備（超級電腦）、岩心庫等設施。本館首次拜訪該機構，商討雙方交流及合作模式，並請該機構持續提供本館最新海洋科學、技術、資源、生物等相關研究成果與資訊，供本館做為展示、教育、研究或蒐藏等目的使用。海洋研究開發機構雖係以研究為主要發展業務，辦理海洋相關學術研討及交流會。然為將海洋最新研究訊息傳遞給一般民眾，仍設有各式教育推廣活動，有一般民眾參觀導覽活動、研究人員至高、國、中、小學上課、培育種子教師、與大學合作共同指導研究生等等，與本館未來發展的方向一致。能與該機構持續合作與交流，是本館努力成為國際級博物館的重要發展業務之一。