日本推動整體牛隻個體識別及追溯制度，係因應國內發生牛海綿狀腦病疫情，著重疫情控制，需掌握國內牛隻從生產至消費端之流向，並恢復消費者信心，整體機制係參考歐美國家控制疫病方式，進行個體標示及異動申報，並未要求農戶紀錄場內其他資訊，亦無包含末端產品安全檢驗，該制度於日本再度發生牛海綿狀腦病零星疫情或核災發生時，均可快速掌握地區牛隻流向，防止疫情或受輻射污染牛隻擴散，雖無法證明牛肉食用安全性，仍有效減少日本消費者疑慮。我國因應美牛事件，推動國內牛隻個體標示追溯制度，但現行屠宰場制度，硬體建設屬各縣市政府，內部的屠宰線卻由業者個別進行屠宰作業，實難掌控並落實相關作業，仍需肉牛飼養、屠宰及販售業者配合參與，同步辦理個體標示，牛隻異動申報、屠宰動線分區與並提升屠宰品質，方能達到最佳效果。