兩岸因長期政治上之特殊關係及雙方公告可申請品種權之植物種類差異，迄今未有相互受理申請植物品種權案例，導致國內許多作物優良品種於對岸無法獲得法律保護，受非法侵權事件日益增加。再者，兩岸間文字語言相通及兩岸智慧財產業務單位長久以來互不接觸各行其是的結果，也助長了投機仿冒以及抄襲搶註之風氣，著名農產品產地名稱搶註情形時有所聞。行政院農業委員會為瞭解並強化兩岸農業智慧財產權保護，於99年3月3日至6日組團赴中國大陸考察植物品種權及證明商標等農業智慧財產權業務，期建立兩岸農業智慧財產權相關業務溝通管道與平台，以加強業務交流，俾維護我國研發人員、農民及兩岸消費者之權益。