大陸近年來大力闢建深水港並發展保稅港業務以吸引航商進駐，已造成台灣地區各港之競爭壓力，面臨兩岸港口發展，基隆港務局除持續推動港埠基礎設施以提升作業效率之外，有關彈性費率方面將研擬有效激勵航商長期進駐之優惠措施，以為因應。未來如何利用兩岸直航的合作機會，研擬轄區各港發展定位，創造我港的競爭優勢，將是未來我港努力方向。兩岸在互惠互利的原則之下，充分發揮雙方產業優勢，進一步實質的合作，共同把餅做大而且裡面的餡要更為豐富，亦即善用我方高科技產業、品牌優勢，以港作為延伸，發展國際物流倉儲區、自由貿易港區等加值型事業。