日本農產品之農藥安全使用管理，除於2003年經由政府組織改革成立消費安全局，妥善配置人力，專司所職，並透過各種病蟲害綜合防治技術研發、農藥登記管理、風險評估及各種栽作制度之推動，如特別栽培法、全農安心認證系統及有機農法等，以達到農產品安全品質管理。在農藥殘留監測管制方面，由農林水產省、厚生省及各都道府縣等相關單位自田間、果菜市場、超市、港口等建立一個緊密之監測網。由於日本國民所需之農產品半數以上來自國外進口，因此，農產品品質監測自果菜市場、市售如超市、量販店等之流通管道為其農藥殘留監測重點，此與我國大相逕庭。並於近年來著手修訂農藥殘留基準更加嚴格之規範及推動農產品生產履歷制度等，配合全國資訊e化作業計畫，加強資訊透明化等，充分達成政府確保食品安全之政策目標。此等完善之組織再造、策略規畫與推動，對確保國民食的安全及保護生態環境上助益甚大，值得我國學習。