近年來次世代定序技術(next generation sequencing, NGS)已被積極應用於公衛實驗室，用於分析病原菌株與微生物感染診斷。NGS技術之應用關鍵，在於如何分析取得的大量DNA序列，擷取所要的資訊。參加此INFORM研習與會議之 目的，在於了解美國公共衛生機構應用NGS技術，在傳染性疾病之監測與流行病學調查之進展，參與此會議可收集分析NGS產生之巨量DNA序列的工具、分析流程、品質管控、與未來的研究方向。此次INFORM2017有超過600人參加，由研習與會議簡報知悉，美國各州公衛實驗室已都具有使用NGS技術分析菌株的能力，也擁有應用NGS分析結果進行疫情研判和流行病學調查之實務經驗。雖然會議簡報的內容都使用SNP方式分析NGS序列，以建構菌株親緣關樹，但為了能讓菌株的基因資料可跨實驗室比對，美國疾病管制預防中心與歐洲相關人員的共識，將使用cgMLST (或wgMLST)的分析策略。我國疾病管制署實驗室因應NGS技術的發展與應用趨勢，也已於2014年前開始發展與應用NGS技術，進行菌株基因分型的研究與提升實驗室NGS的分析量能。因應歐美先進國家公衛實驗室的發展趨勢，防疫機關的國家實驗室應招募生物資訊人員，以強化NGS技術的應用量能，才能與先進國家技術接軌。