此次聯合國生物多樣性公約秘書處第十三屆締約國會議(Convention on Biological Diversity, Conference of Party 13)，與卡塔赫納議定書第八屆締約國會議(Cartegena Protocol, COP-MOP 8)及名古屋議定書第二屆締約國會議(Nagoya Protocol, COP-MOP 2)共同召開。在主辦國墨西哥代表宣布坎昆宣言(Cancun Declaration)下，開始為期14天的締約方大會(2016年12月4日至17日)，強調地球上的生命和我們的共同未來正處於危急關頭，迫切需要採取有力、負責任的行動，必須與大自然和大地之和諧相處，以實現維護生物多樣性及永續利用。因此，必需努力將生物多樣性納入主流，建立適應各國需要和國情的有效體制、立法和監管框架，並採取包容性經濟、社會和文化辦法，充分尊重大自然和人權下，達成愛知生物多樣性目標(Aichi Biodiversity Targets)和 2050 年願景「與大自然和諧相處(Living in Harmony with Nature)」。 會議期間，討論重點生物多樣性公約、卡塔赫納生物安全議定書及名古屋公平獲取遺傳資源與惠益均享議定書，等三個大項目，共同整合及落實執行，分成兩個工作組(working group)，其中第一工作組議題包括，各國執行成效、財務機制和資源、遺傳資資源管理與惠益分享、加強能力建設、風險評估與管理、越境管理及改性活生物體管理及尊重原住民人民和地方社區等；而第二工作組括如何將維護生物多樣性及永續利用落實於農業、林業、漁業上，且針對海洋生物多樣性、海洋保護區、海洋廢棄物及噪音、海洋酸化等海洋保育、外來入侵種管理、合成生物學、關於授粉媒介評估影響、加強執行實現愛知生物多樣性目標的戰略行動及返還傳統知識的相關準則等。 此次大會，是第一次嘗試將公約會議及二個議定書大會整合開會，因為利益及各國國情不同，議題複雜且互相關聯，經大會各締約方共同以「折衷」、「積極」及「具建設性」為原則。經過兩週大小會議超過50場以上的努力研討後，各項議題達成共識，大會圓滿於2016年12月17日通過所有案文，對於維護生物多樣性建立重要的里程碑，大會並宣布2018年生物多樣性公約第14屆締約國大會(COP14)將於埃及舉辦。 生物多樣性公約秘書處第13屆締約國會議，進一步審議了一系列實質性，組織和財務問題，並通過了37項決定。審查了正在執行的「2011 - 2020年生物多樣性戰略計劃」和實現愛知生物多樣性目標方面的進度，以及相關執行措施，並審議加強實施情況的行動計劃，包括生物多樣性納入主流化。 卡塔赫納議定書第八次締約方會議通過19項決定。會議期間審議遵約委員會的報告；審查能力建設框架和行動計畫。指導生物安全資料交換所的運作和活動，並討論關於風險評估和風險管理的問題，包括在合成生物學問題和社會經濟因素等問題上採取協調一致的辦法。名古屋議定書第二次締約分會議，審查針對達成愛知目標第16條的名古屋議定書進展狀況，並通過了14項決定，除其他事項外，就需要和全球多邊惠益分享機制的模式，並獲取和惠益分享資訊交換所。 為展現本國執行生物多樣性的努力，於2016年12月14日中午，以「紮根在大地：社區參與和生物多樣性(Rooted in the ground: Community Participation and Biodiversity)」辦理一場周邊會議(side event)，主要分享議題如下：其一分享友邦貝里斯在社區參與緋紅金剛鸚鵡及奇魁普森林保育管理；其二與我國合作之國際鳥盟(Birdlife International)在印尼社區參與森林保護；其三為我國原住民參與社區保育及貢寮在地社區參與水梯田保育的成功案例。主要成果在結合學術團體，環保組織和當地社區的實施有助於改善生物多樣性兩者的地位和人在當地社區福利計劃的努力。成效良好，並獲取媒體國際永續發展研究會(International Institute for Sustainable Development, IISD)的報導。