本次臺、日學術交流暨環保教育參訪主要目的為前往日本熊本縣水俁市與長崎縣長崎市兩地進行學術交流與環保教育考察。水俁作為水俁病原發地點，在20世紀中對當地造成了相當大的損害。目前，當地在經歷了水俁病的事件後，從中吸取了教訓，並在2008年獲選日本13個「環境模範都市」之一。 本次教育旅行除前往水俁了解當地水俁病歷史，並考察當地環保、回收事業「田中商店」之運作外，尚有參觀當地環境教育場域「愛林館」及拜訪熊本學園大學水俁學現地研究中心之行程。在長崎市的行程安排則為前往參觀原爆紀念館及軍艦島。