登革熱本土疫情，每年均會在南台灣造成流行，今年主要流行的是第二型登革病毒株，但是今年登革熱疫情特別嚴峻，確診病例數已超過歷年紀錄，登革熱重症人數也持續攀升，故此，詳細研究及比對此本土流行登革病毒株序列有其必要性，其結果可望在病毒株適應性及致病性提供新的見解並應用。 本次研習拜訪日本國立感染症研究所 (NIID) 位於戶山庁舍的病毒第一部的蟲媒病毒實驗室(Virology I Arboviral laboratory)與病原體基因組分析研究中心(Pathogen Genomics Center)，主要目的為學習如何使用次世代定序技術(next generation sequencing, NGS)來從事登革病毒株檢測與研究，實驗內容包括：進行登革病毒專一性反轉錄聚合酶反應、全基因體library製備、序列分析及註解(annotation)，以及相關的親緣分析等。