「台日藥物法規合作框架協議」業於102年11月5日完成簽署，台日於此架構下，成立工作小組討論具體合作事宜，並每年輪流舉辦「台日醫藥交流會議」，促進雙方交流及瞭解。為落實「台日藥物法規合作框架協議」所簽訂之合作事項，本署業與日本厚生勞動省(MHLW)及醫藥品醫療機器總合機構(PMDA)洽商103年度台日藥品及醫療器材合作議題，並於藥品、醫療器材議題各成立4個工作小組(藥品：新藥審查、學名藥審查、GCP查核及OTC藥物；醫材：查驗登記，臨床試驗，品質管理系統及上市後監視)，期能拓展台日藥物合作成效。 本次「第2屆台日醫藥交流會議」由日方主辦，於今(103)年10月31日至11月1日在日本東京舉行，包含藥品法規、健保、醫療器材三項主軸之研討會及閉門會議，期促進雙方交流及法規接軌，並藉由閉門會議於各工作小組討論基礎上，洽談具體合作事項，深化台日協議簽署後實質效益，建構與國際接規之藥政法規環境。