為配合IHR港埠檢疫核心能力之建設、以及「兩岸醫藥衛生合作協議」之落實，有效降低各種公共衛生風險藉由交通工具與人員移動對國人健康造成威脅，實有深入了解中國大陸檢疫措施之必要性。目前兩岸之間港埠以廈門與金門之距離最近，且自2001 年實行金馬小三通以來，金、廈兩地民眾、交通、貨物之交流頻率逐年增加，加以近年來兩岸直航、陸客來台觀光、擴大民眾透過小三通往返兩岸等開放政策，使兩岸交通與人民交流之頻率呈現倍數成長，復以大陸近年來以「海峽西岸經濟區」的區位戰略，推動各面向對台政策的先行先試，故本研究希望能透過金門、廈門入出境相關檢疫單位的實地參訪及座談，瞭解其港埠的人員檢疫設施、動線規劃及港區衛生等具體作業方式，以及推動IHR指定港埠核心能力的作法，期能對金廈小三通檢疫措施有較為整體且完整之認識，並透過彼此對推動檢疫工作與建置指定港埠核心能力之經驗交換，提出兩岸入出境人員檢疫之相關政策建議。