漁業署漁訓二號船（以下稱本船）於100年6月2日15時（以下均為臺灣時間），搭載海巡同仁四名（分隊長陳振中.隊員林永昌.郭文學.陳泰源）由 高雄出港，經巴士海峽、南中國海、菲律賓、印尼、新加坡、馬來西亞、麻六甲水域進入印度洋、越過赤道航行南半球、經模里西斯、馬達加斯加、繞過非洲大陸經好望角，7月8日抵達大西洋長鰭鮪作業漁場、執行護漁任務，7月21日完成第一階段任務。共登檢我國籍漁船9艘232人次。7月22日入納米比亞華維斯港（原定泊靠開普敦港，因南非罷工事件行程變更）進行6天整補（伙食、日用物資、蔬果採購、油料及淡水添加、船艇與裝備保養），7月27日19時，本船由華維斯出港，進行第二階段大目鮪作業漁區護漁任務。至8月31日止共登檢我國籍漁船23艘675人次。9月6日入開普敦港進行6天整補，任務完成，9月11日22時由南非返航、經好望角繞過非洲大陸、進入印度洋區航經馬達加斯加、模里西斯、麻六甲海峽、馬來西亞、新加坡、印尼、菲律賓、南中國海、巴士海峽，10月17日11時抵高雄漁訓中心碼頭、結束為期138天大西洋漁業巡護任務。本次兩階段護漁任務共登檢我國籍漁船32艘907人次。