超臨界鍋爐的貫流式的本質，導致必須對操作的穩定度和可靠度有必須遵守的限制和預防措施：(1).最小飼水流量：飼水流量與負載成正比關係，但當鍋爐於起動過程中或負載低於25％或30％額定負載時，為確保鍋爐水牆管仍維持最小及平均流量需求，必須於蒸汽進入汽機前在爐體內建立足夠之飼水循環，以避免爐管過熱破損。除非鍋爐飼水流量在所需的極小值之上，鍋爐是不許允點火的。(2).飼水導電度：不同於汽鼓(Drum Type)鍋爐能將懸浮固體物利用連續沖放排出，所有的硬的礦物質及其他污染物都會沉積在加熱面或過熱器的水側，沉積物會導致過熱及破管。如果爐水導電度超出2.0μυ／cm 經過5 分鐘或超出5.0 μυ／cm 經過二分鐘，鍋爐必須熄火停止加熱，運轉人員必須熟練水質控制設備的操作，精準的控制水質，以減少沖蝕及沈積物之傷害。(3).爐管破漏：任何鍋爐都不允許在爐管破漏下運轉。在貫流式機組，爐管破漏會減少該部位及下游的爐管冷卻水流量不足，而使情況是更加嚴重。(4).飼水溫度：每個飼水流量單位需要的加熱量，是決定於飼水入口溫度和受控出口蒸汽溫度之間的差。如果減少飼水溫度，而出口蒸汽溫度卻維持不變(經由二次燃燒overfiring)，進入爐內的熱量也許會超過設計值而導致管材料的損傷。雖然機組設計上未設計停用飼水加熱器；但為了降低最終蒸汽溫度使爐內加熱率維持在設計值以內，停用一組飼水加熱器是必須的。