依據第二屆台菲部長級科技會議決議，台菲將於氣象領域加強合作及共同於APEC架構下研提成立亞太颱風中心的構思。繼上屆於蘇州舉辦的APEC會議，初步構思已經發布給APEC會員國，且同意在下屆(本(99)年3月的ISTWG)會議前先與會員國溝通此案之細節。 為落實此決議，本會協調國內學術單位與菲國氣象局(PAGASA)於99年1月27日至28日於菲律賓舉辦此Asia Pacific Typhoon Workshop (APTW)。 APTW是以學術為主，邀請亞太鄰近國家之氣象局專家、學者共同赴菲探討颱風對於亞太地區之影響與衝擊，由於在氣候變遷下所造成之威脅及未來加強區域性合作之可能。 會議中除了請各國專家學者分享各國對於颱風預測與預防之機制，同時也藉由此會議將台菲將研提之亞太颱風中心計畫書透過簡報方式與各國專家分享及探討。 同時也希望透過吸納各國之意見，修正計畫書之內容俾三月ISTWG正式會議時可以達成共識。