廈門市政府為使廈門成為台灣水果在中國大陸之集散中心，於廈門市場設置「台灣水果銷售集散中心」，並針對進口之台灣水果予以補助，據業者表示，每公噸補助1500元人民幣。由於台灣水果經小三通至廈門所需時間約1~2天，時間較一般海運短，且有廈門市政府之補助，故有部份貿易商改採小三通方式，將台灣水果出口至廈門，甚至轉運至上海或北京。　　經至廈門東渡港小三通碼頭及台灣水果集散中心考察，發現廈門市政府為達其政策目標，讓廈門成為「台灣水果銷售集散中心」，在檢驗、檢疫及通關方便，確實給予相當之便利。惟台灣水果藉由小三通運輸，依出口業者表示，果品損耗達40%-60%，係因運輸途中需換櫃，無法全程低溫運送所致，如能確保運輸過程不會損傷，將可在最短時間內運抵廈門，進而轉運至上海、北京或其他地區，可延長台灣水果上架壽命，提高產品之競爭力。