為鼓勵大陸地區台商子弟學校學生回台升學，並減輕學生返台應試耗費之勞頓與費用，同意於兩所台商學校設置本(96)年國民中學學生基本學力測驗第一次測驗考場，與國內同步舉行考試。本年二所台商子弟學校合計233名學生報考第一次測驗，兩校比照往年模式，分別於兩校設置考場，由本部、中部辦公室及國立鳳新高級中學派員攜卷前往兩校辦理考試，為使試卷順利通關，確保試卷之安全性及保密性，兩校循例於考前分別請廣東及江蘇當局同意試卷及答案卡由廣州白云機場及南京祿口機場入關時，暫不拆封檢查，在加蓋海關封印後即予放行，延時至考試開始前，大陸當局及海關將派員赴考場拆封檢查是否有試卷以外之違禁品，考試結束後，密封的答案卡由原入關機場出關。