日本全國在重要海空港設立檢疫所，執行業務內容包括檢疫業務、輸入動物申報業務及輸入食品監視業務等，這次行程以成田空港檢疫所及東京檢疫所之檢疫業務為重點。日本檢疫所依據厚生勞働省制定之政策，訂定所轄港埠之執行細節/程序，政策之執行能力極強，且人民之守法精神及個人隱私權之尊重亦令人印象深刻，認為自身之健康狀況為個人之責任，並能配合政府訂定之檢疫規定，而檢疫人員執行業務時，均注意個人資料、肖像等隱私權，實值我借鏡。另成田國際機場設施均有整體規劃，人員檢疫動線流暢，整體機場入境運作極有效率，此外，該國檢疫之現代化及國際化程度頗深，除依據國際疫情變化，適時採取即時之檢疫措施外，必要時，並聯合其他部會以建構一完整之邊境檢疫機制。相較於日本機場規劃之完整，及檢疫人力之充裕，未來我國入境港埠應有空間讓檢疫單位實際參與規劃，使整體入出境更有效率，而適時之增加人力，將能提升檢疫品質，有效防杜疫病於境外，此外，面對國際衛生條例2005（International Health Regulations 2005, IHR2005）將於2007年6月施行，日本正積極研擬因應措施，我國雖業已修正施行港埠檢疫規則，惟持續蒐集國際相關規範及各國因應措施，以為修正我檢疫作為，與國際接軌，將是未來檢疫努力之方向。