本次出國研究利用單一核酸多樣性的寡核酸微矩陣列探討37個惡性骨肉瘤的臨床標本與5個惡性骨肉瘤的細胞株的基因變化。常見有基因套數增加的區域(基因套數超過3)有1p22.3 (14.3%)、1q21.3 (14.3%)、1q24.2 (19.1%)、4q12 (14.3%)、5p13.3 (14.3%)、6p21.2-p12.2 (21.4%)、7p22.2 (21.4%)、7p21.3 (16.7%)、7p15.3 (14.3%)、8q22.2-8q24.22 (33.3%)、12p13.31 (21.4%)、12q15 (14.3%)、17p12-p11.2 (26.2%)、Xp22.33 (14.3%)、Xp11.22-p11.1 (16.7%)及 Xq11.2-q12 (14.3%)。而有經常性基因缺損的區域(基因套數低於1.5)有2q33.2-q33.3 (21.4%)、2q37.1-q37.3 (23.8%)、3p14.3-p13 (23.8%)、3p12.1-p12.1 (21.4%)、3q13.31 (45.2%)、4q35.2 (19.1%)、6q14.1-q16.1 (21.4%)、6q24.1-q26 (26.2%)、8p12 (26.2%)、9p24.1-9p13.3 (28.6%)、10p14 (19.1%)、10q21.3 (23.8%)、10q24.1 (21.4%)、10q26.13-q26.3 (19.1%)、13q14.11 (21.4%)、13q14.13-q14.3 (19.1%)、13q21.2 (19.1%)、13q32.3q-33.1 (23.8%)、15q21.1 (19.1%)、15q25.1 (21.4%)、Xq21.2-q21.31 (19.1%)及Xq22.3 (19.1%)。基因套數有大規模增加的區域(及代表性基因)有4q11-q12 (PDGFRA)、6p21.2-p21.1 (DNAH8,DAAM2)、6p21.1 (CDC5L)、7p22.2 (SDK1)、 8q24.11 (SLC30A8)、11q14.2 (RAB38)、12q14.1 (LRIG3)、12q15 (MDM2)、17p12 (COPS3)及 21q21 (BTG3).。基因套數可能完全缺損的區域(及代表性基因)有3q13.31 (LSAMP)、7q35 (CNTNAP2) 及9p21.3 (CDKN2A, LOC646636)。在3q13.31 的缺損經FISH及多重PCR証實，而利用同一多重PCR又找到另一橫紋肌肉瘤細胞株有類似缺損。邊緣系統相關膜蛋白(Limbic system-associated membrane protein，簡稱LSAMP)為位於此一區域的唯一重要基因。利用FISH又在11個惡性骨肉瘤發現兩例有邊緣系統相關膜蛋白的基因缺損，而且定量PCR證明此二例及HOS細胞株其邊緣系統相關膜蛋白的1b型表現量偏低。其中兩例有117.5 to 118.2 Mb 區域缺損的腫瘤(ST98-0626及HOS細胞株)之1a型表現量較高。反轉錄PCR及基因定序發現此二例有一不正常具基因缺損及中止密碼子的1a mRNA。本研究証明邊緣系統相關膜蛋白為一惡性骨肉瘤及橫紋肌肉瘤的抑癌基因，值得進一步做功能性研究。