由於日本為我國遠洋鮪釣船主要出口國家，為加強雙方在鮪釣漁業資料之正確掌握，雙方於九十三年五月二十七日於日本東京水產廳舉行資料核對會議，本署由黃向文技正出席；日方則由福田工課長補佐、富塚敘課長補佐、新美圭司先生予會。本次會議主要討論議題包括：（一）漁船管理：雙方交換有關漁獲回報系統、漁獲量查核、VMS管理體系以及漁船違規處分之規定及案例。（二）有關漁獲資料，日本質疑我國印度洋大目鮪/黃鰭鮪漁獲比例高達1.87，我方表示漁法、漁區及自然因素都可能相關，有關台灣申報漁獲量與日本進口量之差異，我方則表示大西洋部份漁獲予回籍船資料外掛有關，至於有關我國對東西太平洋畫界與IATTC水域不符等，我方說明劃界之理由並表示會適度調整。（三）漁獲資料統計證明書核發，我方說明資料差異原因可能包括轉載等問題，雙方可透過國際組織加強對運搬船之管理消弭此類問題。至於（四）漁船管理政策，雙方則就現有漁船出口、漁船租賃問題、海外投資漁業管制、漁船汰建制度等交換資訊。心得與建議：有關IATTC水域與我管理東太平洋水域存有落差案，應儘速澄清補正；有關印度洋漁獲魚種議題，應儘速謀對策及說詞避免日方在國際間散播不當說法；由於國際漁業組織之管理日益嚴密，對於資料需求及品質提高，為督促業者提昇資料品質以及配合國際漁業管理趨勢，應加強與業者之宣導。