瘤胃微生物主導乳牛飼糧在瘤胃的消化，也影響瘤胃溫室氣體甲烷的產生，但其族群數量與組成受飼料養分影響，因此增加對瘤胃微生物的瞭解，是營養與環保研究的重要工作。本次研習以學習瘤胃微生物研究方法為主題，包括人工瘤胃發酵系統Rusitec (Rumen Simulation Technique) 的設立與運轉、瘤胃微生物培養基培養方法與計數方法及瘤胃微生物的phylogenetic分類方法。Rusitec發酵系統模擬乳牛瘤胃，可以進行較大範圍的飼糧處理研究，做為事先篩選的測試，縮短研究時程同時也顧及動物福利。瘤胃微生物培養與計數，應用L-10培養基進行試管厭氧培養，可以瞭解各類微生物的種類與數量，評估飼糧利用效率。瘤胃微生物的phylogenetic分類是近年發展的方法，以共通性及專一性的細菌16S rDNA序列做為分類方法，未來應可做為微生物定性與定量的方法，目前分類樹及資料庫都在逐步擴展中。