本公司因應未來愈趨嚴格之環保標準，各火力機組陸續加裝煙氣除硫系統勢在必行，目前林口、興達及台中電廠之煙氣除硫系統均為濕式石灰石/石膏法，該法需使用大量淡水及石灰石，且副產物石膏產量有日益過剩及價格下跌之情形。日本開發之海水法煙氣除硫系統，除硫效率可達90%以上，且已有週轉實績。該系統主要優點是使用海水，可大幅節省淡水資源，且沒有固体廢棄物產生。本公司各火力電廠均在海邊，海水取用方便，海水除硫系統係一值得考慮之處理程序。燃煤電廠目前運轉中之煙氣除硫系統廢排水，廢水中含化學需氧量及硝酸氮，有進一步處理之必要。日本方面之技術顯示，使用選擇性陰離子交換樹脂處理，可有效去除煙氣除硫系統廢水之化學需氧量，以生物脫硝法處理，可去除煙氣除硫系統廢水之硝酸氮。長期而言，宜使用薄膜及蒸發等方法，進行電廠廢水零排放規劃，可永久解決電廠廢水排放之環保問題，提升公司環保形象及營運績效。