種緣關係分析是定義或找到新基因的有效方法，且藉由分群的結果常可有效的預測出基因的功能。然而由於基因體計劃的發展，基因庫資料增加速度非常驚人，如何有效率又正確的分析種緣關係是很重要的課題。故此次出國選擇至對生物資訊學很有經驗及成果的實驗室短期進修，並於半年時間內以磷酸轉移酵素系統（PTS）為模型成功的開發出5個不同用途的程式，改進基因庫資料搜尋、擷取及格式轉換的缺失，且成功的建立具整合性資料的種緣關係樹狀圖，並藉分析定義出PTS中HPr kinase基因的Signature序列及其可能的功能及調節機制。改進後的種緣關係分析方法將可提供未來分子生物研究方向之指引，並可縮短未來新基因發現所需的時間。