森林生物多樣性影響生態系的養分循環、生產力及食物網；目前的研究大致認為物種豐富度增加，總生產力會增加，養分保存力會增加。但是這些研究的缺點是對物種增加或減少與自然界發生的現象並不符合，研究的期間也不夠長，很難有定論。在林地內以去除某種重要物種，監測對生態系過程的影響，可能是一個比較實際的研究法。穩定同位素是研究生態系過程的利器，已廣為先進國家生態系研究所運用，國內宜加強此方面的研究。德國生態系研究者已融入歐盟的各種特定議題的研究網絡，對於區域性生態問題的了解與解決有重大的貢獻。生物多樣性的概念在德國已透過森林經營的準則與指標方式漸漸用於實際作業。