此次訪問團行程依行程規劃分為兩部分；紐西蘭與澳大利亞兩階段。紐西蘭的5天行程(2006年8月22日-26日)是因應紐西蘭方面邀請及本會在國科會與該國皇家學會簽署合作協議後的後續計畫，為促進雙邊的實質合作交流，選定該國HortResearch, University of Auckland, Geological and Nuclear Sciences (GNS), Victoria University of Wellington, Foundation for Research, Science and Technology, Royal Society of New Zealand, Ministry of Research, Science and technology, Research and Education Advanced Network of New Zealand (REANNZ), University of Otago, Crop and Food Research 和 University of Canterbury 轄下的11個重點研究單位與相關政府機構及我駐紐西蘭代表處訪問。訪問代表團有團長楊副主委弘敦，代表團團員林處長光隆、李處長世光、鍾處長邦柱、科技組曾組長東澤、科技組謝秘書水龍、及陳計畫經理守達，共七人。此次訪問返國後，本會目前已著手就訪問期間該國所提供的資料，進行促進研究合作領域的篩選。紐西蘭的5天行程之後，緊接著的為參加在澳大利亞墨爾本舉行的台澳生技策略研討會與之後的訪問行程(2006年8月26日-9月1日)。整個研討會除了由臺灣受邀前來的十位講員及本會業務相關人員丁乃琪研究員加入本訪問團以外，加上澳方受邀學者後，參與人數超過40人。在會中及會後，本訪問團也訪問了La Trobe University, Monash University, Australian Synchrotron Project, Commonwealth Scientific and Industrial Research Organisation (CSIRO), Australian Academy of Science (AAS), Department of Education, Science and Training of Australian Government, Australian Research Council (ARC) and Australian Nuclear Science and Technology Organisation (ANSTO) 等8個學術研究、大學與相關澳方政府機構，就未來雙邊合作方向及問題做充分溝通。訪問團並與該國原子核科學與技術組織(ANSTO)就我方在該單位的投資合作計畫，做合作計畫進度的廣泛檢討。澳方在生技策略研討會之後，即將有數位與會學者於近期來台，屆時將與本會進行討論合作方式及部分細節。