2005年年會係日本藥學會自1880年創會以來第125屆年會，從初始創會30名會員至今擁有約2萬名會員的龐大組織，日本藥學會年會係日本藥學界每年舉辦之最大型學術研究發表會，參與者涵蓋日本製藥業界、學術研究單位及政府相關機構，論文議題廣泛，包含藥學方面之所有領域，其有機化學、天然物化學及生藥學之研究在國際上均居於領先之地位，為了吸收生藥學方面之最近研究新知而參與此盛會。會議期間共舉辦紀念演講4場、特別演講26場、受賞演講16場、研討會43場（包括274個講題）及一般學術口頭發表133場（包括980個講題）。此外在東京國際展示場壁報論文會場共發表3470篇論文（分三天發表，平均一天展示1千多篇），其研究範圍涵蓋物理藥學、醫療藥科學、生物藥學、環境衛生藥學、藥學教育、化學藥學、醫療化學、社會藥學等八大類，其中化學藥學類包括有機化學（643篇）、生藥學（80篇）及天然物化學（292篇），共計1015篇。