考古學為史前館的核心研究項目，其中又典藏相當數量的臺灣史前玉器；另史前館所轄卑南遺址公園為國內第一座結合遺址和環境生態的文化公園，是重要的文物資產維護及教育展示單位。為充分發揮史前文化博物館及卑南遺址公園的功能，和世界相似博物館及遺址管理單位進行交流學習，讓史前館的研究與展示可以與時俱進，乃為重要的課題；又史前館從2016年度起開始推動執行『智慧博物館』計畫，也藉此行了解中國大陸博物館近年來在科技應用上的最新情況。