臺灣的文蛤養殖產業具有長久的歷史，再加上養殖業者為提高產能及特殊育種需求而自國外引進不同文蛤進行養殖，臺灣的養殖文蛤種類在分類學上仍有部分疑義。本所於民國108年利用生命條碼技術進行鑑定，發現臺灣淡水河產的文蛤為尚未被描述的新種，但過去長期以來被為M. lusoria，其原產於日本及韓國南部。從親緣演化來看，本種與中華文蛤(M. petechialis)的親緣關係較近(Hsiao et al., 2019)。臺灣淡水河產的文蛤主要棲息於河口的平坦沙灘地與潮間帶的沙質海底。而日本研究報告指出，日本產 M. lusoria 幼貝偏好棲息於較上游河段，推測是上游河段環境變化較小（Hashiguchi et al .,2014），且由其族群移動研究也發現， M. lusoria 有隨著成長往河口移動的趨勢（Henmi et al ., 2014）。