Pseudomonas viridiflava為世界上重要的植物病原細菌，寄主範圍廣，分布在世界各地，可危害多種作物。近年國內已陸續發現此菌造成番茄髓壞疽病、胡瓜細菌性白枯病及十字花科蔬菜細菌性葉枯病，為了瞭解來自不同寄主之病菌遺傳變異性，收集了來自不同寄主的P. viridiflava分離株，利用次世代定序以及組裝軟體（包括Abyss，SOAPdenovo和Velvet）組裝定序數據。所組裝的序列數據使用RAST（Rapid Annotations using Subsystems Technology）預測組裝序列的基因。為了了解台灣分離株的變異性，從所組裝的基因中提取了三個管家基因gyrB，rpoB和rpoD的部分序列用於multilocus locus analysis分析（MLSA）。發現來自台灣不同寄主的P. viridiflava在系統發育分析中可分為三個進化支，顯示各分離株變異性高。