發展中草藥科技為目前政府之重要政策，為落實中藥材的管理，從中藥材的基原鑑定、品質成分確認、品質維護、中藥產品製造及其市場流通管理等開始，逐步的建立完整的中藥材品質管理制度為當前最重要的課題之一。然而中藥之品種繁多，有些中藥材之基原鑑別甚為複雜，藥品名稱及來源紊亂，且常有代用品、混用品或誤用品充斥，因而造成療效不彰、中毒或誤用的情形發生，所以有必要對基原較複雜之藥材加以釐清。 由於我國中藥材近八成從中國大陸進口，為完備中藥材之源頭管理機制，過去衛生署時代分三階段實施中藥材品質管理機制：第一階段為推動中藥材之包裝標示，要求市售之中藥材飲片，其標籤或包裝均應符合標示事項處理原則，目前已公告應標示之中藥材品項共324種。第二階段則針對重金屬及黃麴毒素等異常物質，參考相關國家當前管制原則，訂定各種異常物質限量標準，以確保中藥材之安全與衛生，迄今也已指定公告91種中藥材之各種異常物質限量標準。第三階段則致力於完備中藥材之源頭管理機制，包括進口產品文書認證及落地追蹤等工作。而「中藥材追蹤溯源制度」也蘊育而生。中藥材追蹤溯源監視制度，將中藥材外包裝產品標籤或包裝，貼上條碼，提供名稱、產地、來源、適應症、副作用等資訊，管制中藥材進口會更有效率，將可防堵黑心中藥材進口。