面對新興傳染病(Emergencing Infectious Disease；EID)的衝擊與威脅，對公共衛生與防疫體系無疑是最嚴峻的挑戰，實驗室如何有效的檢測出EID的浮現，實為一大課題。此外由於病原體不斷的快速演化或再浮現，檢驗技術亦須不斷的更新與縮短檢測時間，以期能早期的偵測與防治使疫情不至再進一步擴大，其交通的便捷與迅速快速地偵測出致病原更顯出其重要性。分子生物學這些年來有長足進步，比從前利用傳統方法分離病原體以後，再加以鑑定的確是一項演進，也因此找到了某些新的病原體如：HCV、HHV-8、SARSCoV、GB virus C、HepatitisG virus、hantavirus、TTV等，這些方法可以是： 1.Immunoreactive cDNA expression Library篩選 2.Representational Difference分析 3.DNA microarray 4.Degenerated PCR 而SISPA(sequence-independent single primer amplification) 及CODEHOP-mediated PCR為這些方法的再修正，以期能偵測到不同的病原體或同科的新病毒等。 腸病毒群在台灣地區是相當活躍的，不同的地區、環境、氣候及社經、年齡等因素，都會影響其流行趨勢及血清型別。傳統之檢驗技術如何傳承及引用新興的檢驗技術並如何配套使用，對於台灣地區整體腸病毒的流行、監測、治療與預防有其需求性。分子生物學的進步揭開了病原體的原始面貌，藉由最基本的核苷酸序列，不僅可進一步回溯腸病毒的演化，並可依所累積相同生物特性之表現型配合先進的儀器設備來做為檢驗方法的設計與改良，進而準確及快速提供病原體資料。